小麦研究所建于1948年,地处晋南粮果带中心区域-临汾市尧都区，前身是“晋绥边区临汾农事试验场”。1979年5月，定名为山西省农业科学院小麦研究所。2019年10月，山西农业大学与山西省农业科学院合署，成立新的山西农业大学，更名为山西农业大学小麦研究所（山西省农业科学院小麦研究所）。2020年4月，山西省农业科学院隰县农业试验站划归我所。主要从事小麦种质资源创新、新品种选育、分子生物技术、作物栽培、植物保护研究与示范推广，并针对全省农业产业技术与发展需求，开展玉米、大豆、向日葵、花生、大麦、果树、蔬菜等作物种质创新和新品种新技术研究与推广。

下设水地育种研究室、有机旱作研究室、综合化验室、植物保护研究室、经济作物与杂粮研究室、分子育种研究室、蔬菜林果研究室、特色作物研究室、玉米作物研究室、高寒作物研究室10个科研科室和党政办公室、科研办公室、社会服务办公室、后勤保卫科、人事科、财务资产科、隰县农业试验站7个管理科室。

在职职工170人，其中研究员13人，副研究员50人，助理研究员45人，博士10人，硕士48人。享受国家特殊津贴专家5名，中央联系高级专家1名，全国优秀农业科技工作者1名，山西省科技功臣1名，山西省“333”人才工程省级人选1人，山西省学术带头人2人，山西省劳动模范5人，“三晋英才”2人，临汾市高层次人才10人，临汾市政协委员1人。

拥有所部、韩村、洪堡和隰县试验站4个试验基地，面积3700亩；建有山西省谷物品质分析技术共享实验室、植物生理与土壤研究实验室、小麦分子育种实验室和有害生物综合治理实验室，仪器设备总价值2000余万元；是国家小麦产业体系临汾综合试验站挂靠单位。

建所以来，主持或承担科技部、农业部项目62项，省级项目275项；获国家、省部级奖项109项。其中国家科技进步一等奖2项、二等奖5项；省级科技进步一等奖14项、二等奖37项、三等奖48项；授权发明专利36项，制定省级地方标准21项；审定作物品种96个。生产上有影响的品种：晋麦10号、晋麦31号、晋麦33号、晋麦45号、临优145、晋棉7号、晋单34号等，目前大面积应用的有临丰3号、晋麦92号、晋麦95号、品育8012，其中品育8012是2020、2021年山西省主推小麦品种。集成的“小麦产量品质同步提高抗逆栽培技术体系”是山西省小麦生产主推技术。发表论文1400余篇，出版《山西小麦》、《小麦品质及其改良》等学术著作40余部。